Одељење за здравствено осигурање обавља послове који се односе на обезбеђивање јединствене примене прописа из области обавезног здравственог осигурања војних осигураника и доношење одговарајућих аката и упутстава ради остваривања права на здравствену заштиту, прописивање и организовање рада лекарских комисија за решавање стручних питања везаних за здравствену заштиту војних осигураника, примену прописа из области међународног здравственог осигурања, израду, оверавање и издавање здравствених књижица и картица здравственог осигурања и друге послове у вези са делокругом рада.
Одељење за здравствено осигурање састоји се од Одсека за проијаву на здравствено осигурање, издавање и оверу здравствених књижица и Одсека за остваривање права из здравственог осигурања.
У саставу Одељења за здравствено осигурање налазе се и организациони састави у унутрашњости који обављају послове који се односе на давање стручне и правне помоћи по питању остваривања права из домена здравствене заштите и поступање у првом степену и сарадњу са цивилним здравственим установама са територије (зоне) надлежности, и то:
1) Група за послове са војним осигураницима – Ниш;
Територијална надлежност: Пирот, Бабушница, Бела Паланка, Димитровград, Ниш, Сврљиг, Гаџин Хан и Алексинац.
2) Група за послове са војним осигураницима – Нови Сад;
Територијална надлежност: Нови Сад, Бачка Паланка, Врбас, Бач, Жабаљ, Бечеј, Темерин, Беочин, Бачки Петровац, Тител, Србобран и Сремски Карловци.
3) Група за послове са војним осигураницима – Крагујевац;
Територијална надлежност: Крагујевац, Смедеревска Паланка, Велика Плана, Аранђеловац, Топола, Баточина, Лапово, Рача, Кнић, Јагодина, Ћуприја, Параћин, Свилајнац и Деспотовац.
4) Група за послове са војним осигураницима – Ваљево;
Територијална надлежност: Ваљево, Лајковац, Уб, Љиг, Мионица и Осечина.
5) Група за послове са војним осигураницима – Ужице;
Територијална надлежност: Ужице, Пријепоље, Прибој, Нова Варош, Пожега, Бајина Башта, Косјерић, Ариље и Чајетина.
6) Група за послове са војним осигураницима – Крушевац;
Територијална надлежност: Крушевац, Трстеник, Александровац, Брус,Ћићевац, Варварин и Ражањ.
